Mi actividad investigadora principal se ha centrado en estudiar el efecto de la especie invasora, cangrejo rojo (Procambarus clarkii), en la estructura y funcionamiento de los ecosistemas acuáticos mediterráneos, especialmente en las marismas de Doñana. Me interesa especialmente estudiar las características ecológicas tienen las especies invasoras para entender mejor cómo y cuándo colonizan los nuevos ecosistemas a los que llegan con el objeto de poder adoptar estrategias y recomendaciones adecuadas para llevar a cabo su gestión. Otras áreas de la ecología, en las que he trabajado están relacionadas con la ecotoxicología, estudiar los efectos de la contaminación por metales pesados en nuestros ecosistemas acuáticos. Actualmente trabajo en dos líneas de investigación, una relacionada con diferentes usos de isoótopos estables (p.ej descripción de redes tróficas en humedales; migración de las especies, evaluación descomposición hojarasca en ríos por invertebrados o análisis de paleodietas con coprolitos) y, la otra relacionada con el análisis de la influencia del cambio de usos en la provisión de servicios, especialmente los hidrológicos, pesca y/o la polinización.